Nhiệm vụ T là một hoạt động bí mật để cứu thế giới khỏi sự hủy diệt. Được đào tạo thành ninja từ khi còn nhỏ, Botan Negoro, được nuôi dưỡng để trở thành điệp viên tối thượng, hợp tác với một điệp viên xuất sắc khác, Kuruma. Mục đích của họ là khôi phục di sản của nhà phát minh thiên tài Nikola Tesla, "Mảnh vỡ của Tesla".