A.D. 2089 - 80 năm đã trôi qua kể từ Chiến tranh Không gian I đã thay đổi cuộc sống của cả loài người và chủng tộc Zentraedi. Cả hai chủng tộc đang hòa bình trên Trái đất khi một chủng tộc ngoài hành tinh mới được gọi là "Marduk" xuất hiện trong Hệ Mặt trời.